Цель игры — провести лягушку к каждому из пустых домов в верхней части экрана. Игра начинается с трех лягушек. Потеря всех лягушек — игра окончена. Игрок использует джойстик в четырех направлениях, чтобы один раз подпрыгнуть на лягушке. В Frogger можно играть либо в одиночку, либо в два игрока поочередно.

Лягушка начинается в нижней части экрана, где находится горизонтальная дорога, по которой мчатся транспортные средства, такие как гоночные автомобили, багги, грузовики и бульдозеры. Игрок должен вести лягушку между противоположными полосами движения, чтобы не стать жертвой дорожно-транспортного происшествия и не потерять жизнь. После пересечения дороги две основные части экрана разделяет срединная полоса. Верхняя половина состоит из реки с бревнами, аллигаторами и черепахами, движущимися горизонтально по экрану в противоположных направлениях. Прыгая по быстро движущимся бревнам и спинам аллигаторов и черепах, игрок может вывести лягушку в безопасное место. Игрок должен избегать змей, выдр и открытых пастей аллигаторов. Ярко окрашенная самка лягушки иногда находится на бревне, и ее можно нести за бонусные очки. В самой верхней части экрана расположены пять «лягушачьих домов», и как минимум один из них всегда открыт и доступен. Иногда они содержат бонусных насекомых или смертоносных аллигаторов.

Когда все пять лягушек оказываются в своих домах, игра переходит на следующий уровень с повышенной сложностью. После пяти уровней сложность ненадолго снижается, а затем снова постепенно увеличивается после каждого уровня. Таймер дает 30 секунд, чтобы направить каждую лягушку в один из домов, и сбрасывается до 60 тиков, когда лягушка теряет жизнь или лягушка благополучно достигает дома.