Введение в GenoScore
Генетическая оценка (GenoScore: приложение для оценки относительной ДНК) — это приложение для Android, которое оценивает потенциальные комбинации биологических родственников с использованием многоуровневой системы и алгоритма. Он позволяет выбирать стандартные наборы STR и предоставляет индикатор с цветовой кодировкой, показывающий, необходим ли дальнейший сбор или анализ. Зеленый цвет указывает на то, что дальнейший сбор не требуется, желтый цвет рекомендует собирать данные у дополнительных родственников или использовать дополнительные анализы, а красный указывает на низкую медиану КВ. Оценка основана на ожидаемом медианном LR для каждого сценария с поправкой на набор STR и комбинацию родственников. GenoScore дает рекомендации о том, каких родственников следует собирать, но только анализ ДНК даст истинный результат дела.
GenoScore — мобильное приложение для платформ Android. GenoScore оценивает потенциальные комбинации биологических родственников 1-й, 2-й и 3-й степени на основе многоуровневой системы и алгоритма оценки, который включает в себя несколько возможных родственников, таких как супруги, сводные братья и сестры и двоюродные братья. GenoScore позволяет выбирать общие наборы STR на основе ожидаемого количества локусов в каждом наборе, а также использовать старые и новые технологии STR.
Приложение предоставляет общий балл для каждого родственника или комбинации родственников и переводит этот балл в индикатор с цветовой кодировкой (зеленый, желтый или красный), который указывает на необходимость дальнейшего сбора биологических родственников или дополнительных анализов STR.
Зеленый индикатор указывает на то, что выбранные родственники и локусы STR обычно приводят к медиане LR = 1 000 000 или выше, и дальнейший сбор дополнительных родственников, скорее всего, не потребуется. Медианное значение LR, равное 1 000 000, в большинстве случаев является очень консервативным и должно приниматься во внимание сборщиками/лабораторией.
Желтый индикатор указывает на то, что выбранные родственники и локусы STR обычно приводят к медиане LR = от 100 до ~999 999, и рекомендуется собрать данные у дополнительных близких биологических родственников или использовать дополнительные анализы STR.
Красный индикатор указывает на то, что выбранные родственники и локусы STR обычно приводят к медиане LR < 100.
Оценка родословной/родственников частично основана на предыдущей системе оценки родственников, но обновлена и включает в себя многих других возможных родственников, таких как супруги (если есть дети), тетя/дядя, племянница/племянник, сводные братья и сестры и двоюродные братья, включая их комбинации. .
Оценка основана на ожидаемом медианном коэффициенте правдоподобия (LR) для каждого сценария родословной, скорректированном для каждого типа набора STR. И набор STR, и комбинация родственников будут влиять на ожидаемый средний LR. Оценка основана на обширном моделировании, выполненном на многих родословных и нескольких наборах STR (пока неопубликованных).
Хотя GenoScore предоставляет практикующим специалистам рекомендации относительно того, каких биологических родственников лучше всего собирать, пользователи должны предвидеть диапазон отношений правдоподобия для каждого сценария родословной, и только анализ ДНК и сопоставление дадут истинный результат в конкретном случае.
GenoScore — мобильное приложение для платформ Android. GenoScore оценивает потенциальные комбинации биологических родственников 1-й, 2-й и 3-й степени на основе многоуровневой системы и алгоритма оценки, который включает в себя несколько возможных родственников, таких как супруги, сводные братья и сестры и двоюродные братья. GenoScore позволяет выбирать общие наборы STR на основе ожидаемого количества локусов в каждом наборе, а также использовать старые и новые технологии STR.
Приложение предоставляет общий балл для каждого родственника или комбинации родственников и переводит этот балл в индикатор с цветовой кодировкой (зеленый, желтый или красный), который указывает на необходимость дальнейшего сбора биологических родственников или дополнительных анализов STR.
Зеленый индикатор указывает на то, что выбранные родственники и локусы STR обычно приводят к медиане LR = 1 000 000 или выше, и дальнейший сбор дополнительных родственников, скорее всего, не потребуется. Медианное значение LR, равное 1 000 000, в большинстве случаев является очень консервативным и должно приниматься во внимание сборщиками/лабораторией.
Желтый индикатор указывает на то, что выбранные родственники и локусы STR обычно приводят к медиане LR = от 100 до ~999 999, и рекомендуется собрать данные у дополнительных близких биологических родственников или использовать дополнительные анализы STR.
Красный индикатор указывает на то, что выбранные родственники и локусы STR обычно приводят к медиане LR < 100.
Оценка родословной/родственников частично основана на предыдущей системе оценки родственников, но обновлена и включает в себя многих других возможных родственников, таких как супруги (если есть дети), тетя/дядя, племянница/племянник, сводные братья и сестры и двоюродные братья, включая их комбинации. .
Оценка основана на ожидаемом медианном коэффициенте правдоподобия (LR) для каждого сценария родословной, скорректированном для каждого типа набора STR. И набор STR, и комбинация родственников будут влиять на ожидаемый средний LR. Оценка основана на обширном моделировании, выполненном на многих родословных и нескольких наборах STR (пока неопубликованных).
Хотя GenoScore предоставляет практикующим специалистам рекомендации относительно того, каких биологических родственников лучше всего собирать, пользователи должны предвидеть диапазон отношений правдоподобия для каждого сценария родословной, и только анализ ДНК и сопоставление дадут истинный результат в конкретном случае.
Читать ещё